印尼被禁赛的原因主要是政府干涉足球事务，违反了国际足联（FIFA）的相关规定。具体事件如下：

1. 印尼体育部与足协的矛盾：2015年3月，印尼体育部与足协发生矛盾，印尼足协允许两支俱乐部参加超级联赛，但未获印尼体育部的认可。印尼体育部随后决定暂停联赛，并计划成立过渡委员会取代印尼足协。

2. 国际足联的处罚：国际足联要求印尼政府停止干涉足协事务并恢复联赛，限定期限为2015年5月29日。由于印尼政府未能在规定时间内恢复联赛，国际足联于2015年5月30日对印尼足协实施了全球禁赛，禁止印尼参加任何与足球有关的国际活动。

3. 亚足联的跟进：亚足联随后也宣布禁止印度尼西亚足协参加由亚足联或国际足联举办的任何赛事活动，包括2015年的世预赛40强赛。

4. 其他相关事件：在2018年世界杯预选赛中，印尼因政府干涉足球事务再次被FIFA和亚足联处罚，所有关系到印尼的比赛被取消。

这些事件反映出印尼政府和足协之间存在严重的矛盾，以及印尼政府在足球事务上的过度干涉，这是导致印尼被禁赛的主要原因