扎卡兄弟拥有不同国籍的原因主要与他们的家庭背景和历史背景有关。他们的父亲在科索沃战争期间因参与示威游行入狱，之后为了生活，拉吉普和妻子伊莱带着孩子们移民到了瑞士巴塞尔。因此，扎卡兄弟在瑞士出生并成长，所以他们拥有瑞士国籍。
然而，尽管他们拥有瑞士国籍，扎卡兄弟的哥哥陶兰特-扎卡选择为阿尔巴尼亚效力，而弟弟格兰特-扎卡则选择代表瑞士国家队参赛。这种选择可能与他们的个人认同、家庭传统以及当时的政治环境有关。科索沃在90年代因为塞族和阿族之间的内战，导致生存环境恶劣，扎卡一家为了生活选择移民瑞士。尽管科索沃在2016年之前不被国际足联承认，但扎卡兄弟仍然选择了代表各自认为合适的国家队参赛。
总的来说，扎卡兄弟拥有不同国籍的原因是多方面的，包括他们的家庭背景、历史背景以及个人选择。