1998年夏天，斯科蒂·皮蓬在迈克尔·乔丹第二次宣布退役后，离开了芝加哥公牛队，以5年7736万美元的合同加盟了休斯顿火箭队。在1998-1999赛季，由于劳资纠纷，常规赛缩水到50场，皮蓬场均贡献14.5分、6.5篮板和6助攻，投篮命中率仅为43.2%。尽管如此，他在季后赛中场均可以得到18.2分、11.8篮板和5.5助攻。
赛季结束后，即1999年夏天，皮蓬被交易到了波特兰开拓者队。皮蓬在火箭队期间一直打到2003-2004赛季结束，随后在2004年退役。
因此，皮蓬从公牛队出去后，首先加盟了火箭队，然后又转会到了开拓者队。