1999年芝加哥公牛队解散的原因是多方面的，主要包括以下几点：

管理层与教练的冲突

教练菲尔·杰克逊与球队管理层之间存在严重分歧，导致他在三连冠后离队。新教练缺乏经验，导致球队战术混乱，进一步削弱了球队实力。

球员转会

目睹教练被解雇，其他队员如史蒂夫·科尔等相继转会，进一步削弱了球队的整体实力。

NBA停摆

1998-99赛季受到NBA停摆的影响，球员状态不佳，准备不足。停摆期间，资方与劳方未能达成协议，导致赛季推迟和取消，球员们失去了继续争冠的动力。

球队老化与缺乏新鲜血液

公牛队的老化阵容在缺乏新鲜血液补充的情况下，难以维持竞争力。尽管乔丹在1998年仍然表现出色，但岁月的流逝和伤病的困扰使得他在防守端的影响力下降。

劳资双方分歧

NBA劳资双方在大停摆期间存在巨大分歧，资方欲修改工资帽制度并对高薪球员工资封顶，这遭致劳方的反对，最终导致停摆和赛季取消。

内部矛盾

公牛队内部存在诸多矛盾，包括管理层与球员之间的矛盾，以及球员之间的不和谐。这些矛盾在球队面临重要抉择时显得尤为突出，影响了球队的稳定性和战斗力。

球员退役与伤病

1998年乔丹选择退役，皮蓬和罗德曼等核心球员也面临伤病和年龄老化的困扰。这些关键球员的离队或状态下滑，使得公牛队难以维持之前的辉煌。

综上所述，1999年公牛队的解散是多种因素共同作用的结果，包括管理层与教练的冲突、球员转会、NBA停摆、球队老化、劳资双方分歧、内部矛盾以及关键球员的退役和伤病。这些因素共同导致了芝加哥公牛队的辉煌时代成为过去。