瑞丽进行检测的主要原因是为了 有效阻断疫情扩散传播路径。具体原因包括以下几点：

发现输入性病例：

2020年9月14日，瑞丽市发现了2例输入性新冠肺炎确诊病例，均为缅甸偷渡来瑞丽的人员。

防止疫情扩散：

为了有效阻断疫情扩散传播路径，瑞丽市立即采取了包括开展城区全员核酸检测在内的紧急措施。

全员参与：

瑞丽市对城区全员开展核酸检测，费用由政府承担，确保检测的全面性和准确性。

及时发布消息：

方案确定之后，有关消息将及时发布，以确保公众了解疫情动态和防控措施。

严格管理：

根据疫情防控工作需要，瑞丽市还采取了其他严格的管理措施，如禁止个人探亲访友旅游、设置采样点、安排医护人员全天候工作等。

综上所述，瑞丽进行检测的主要目的是为了及时发现和控制疫情，防止其扩散和传播，保护公众的健康和安全。