孔卡未能入选阿根廷国家队的原因是多方面的，主要包括以下几点：

职业生涯位置与阿根廷国家队战术不符：

孔卡主要司职古典前腰，需要掌握大量球权来组织进攻。然而，阿根廷国家队已经拥有像梅西这样的顶级球员，他在场上同样会占据大量球权。孔卡的踢法在阿根廷队中难以找到合适的位置，同时也无法与梅西形成有效的配合。

俱乐部层面与国家队层面的差异：

孔卡虽然在中超联赛中表现出色，但他在巴甲和中超的级别与欧洲顶级联赛相比还是有所差距。阿根廷国家队主教练可能认为孔卡在低级别联赛中的表现不足以证明他在国际大赛中的实力。

身体条件与防守能力：

孔卡的身体条件并不突出，尤其是在身体对抗方面。现代足球对球员的防守能力有较高要求，而孔卡在这方面存在明显短板。他在场上往往只能专注于进攻，而无法有效参与防守，这在阿根廷队这样的强队中是不可接受的。

性格与团队配合问题：

孔卡的性格决定了他在场上需要成为绝对的核心，这与其他球员需要围绕他转的情况不同。在阿根廷国家队，他需要适应与其他世界级球星的合作，而他过于强势的球风可能会破坏团队的和谐与平衡。

综上所述，孔卡未能入选阿根廷国家队的主要原因在于他的技术特点、身体条件以及与球队战术体系的不匹配。尽管他个人能力出众，但在阿根廷队中他难以找到合适的位置，同时也无法与其他顶级球员形成有效的配合。