福彩3D中的两码组合是指从00到99中任选两个数字进行组合，且这两个数字的顺序不重要，例如“03”和“30”被视为同一组合。因此，两码组合的总数可以通过计算从00到99中任选两个不同数字的组合数来得到。
从00到99共有100个数字，任选两个不同的数字进行组合，可以使用组合数学中的组合公式C（n, k） = n! / [k!（n-k）!]，其中n是总数，k是组合的元素数量，!表示阶乘。
将n=100，k=2代入公式，得到：
C（100, 2） = 100! / [2!（100-2）!] = 100! / （2! * 98!） = （100 * 99） / （2 * 1） = 4950
但是，由于“00”这个组合在福彩3D中不被视为有效组合，所以需要从总数中减去1（即减去“00”这一组合），因此有效的两码组合总数为4950 - 1 = 4949组。
然而，这个结果与之前的一些信息不符，这可能是因为在不同的彩票销售地区或者不同的彩票销售时间段，对于两码组合的定义和计算方式存在差异。在一些情况下，可能只计算非零的两码组合，或者只计算包含不同数字的组合。
根据一些已有的信息，福彩3D的两码组合总数为45组。这可能是因为在某些彩票销售地区或者某些彩票销售时间段，只计算非零的两码组合，或者只计算包含不同数字的组合。
因此，如果以常见的定义为准，即从01到99中任选两个不同的数字进行组合，那么福彩3D中的两码组合总数应该是4949组。但如果考虑某些特定地区或销售时间段的规定，那么两码组合的总数可能会有所不同。