邓肯上的大学是 维克森林大学（Wake Forest University）。他在大学期间表现出色，大二时期场均拿下16.8分12.5篮板，获得最佳防守球员以及最佳阵容等荣誉。尽管他放弃了在NBA选秀中成为状元的机会，选择完成大学学业，但他在大三和大四的时候场均砍下20+的得分，并且拿到了心理学学位。大学时期的邓肯在攻防两端都展现了出色的统治力，各项技术几乎没有短板，为未来的职业生涯打下了坚实的基础。