科瓦奇在2018年与拜仁慕尼黑签下了一份 为期三年的执教合同，合同至2021年6月30日。根据这份合同，科瓦奇的 年薪大约为450万欧元。尽管他在合同期内的第二年就下课了，但根据合同条款，他仍然可以获得全额的德甲夺冠奖金。

因此，拜仁慕尼黑在科瓦奇执教期间支付给他的薪水总额为他三年年薪的总和，即1350万欧元（450万欧元/年 × 3年），以及他可能获得的全额冠军奖金。需要注意的是，这些数字是基于2018年的合同情况，具体的薪水支付和奖金金额可能会因合同条款的更新或实际执行情况有所调整。