3D游戏中，选择6个号码进行组选3的投注， 需要支付40元。组选3是指从000-999的数字中选择一个三位数，且这个三位数中有两个数字是相同的。例如，中奖号码为223，则视为中奖，无论选择的顺序如何（即223、232、322）。
在投注时，可以选择不同的复式投注方式，例如：
选2个数字进行组选3复式投注，包含2注组选3号码，投注额为4元。
选3个数字进行组选3复式投注，包含6注组选3号码，投注额为12元。
选4个数字进行组选3复式投注，包含12注组选3号码，投注额为24元。
选5个数字进行组选3复式投注，包含20注组选3号码，投注额为40元。
选6个数字进行组选3复式投注，包含30注组选3号码，投注额为60元。
因此，选择6个号码进行组选3的投注，无论采用何种复式方式，都需要支付40元。