3D万能两码的组合有以下几种：

组六

02 04 05 07 09

24 25 27 29

45 47 49

57 59 79

13 16 18

36 38

68

组三

00 11 22 33 44 55 66 77 88 99

总结起来，3D万能两码共有 15个组六和 6个组三组合。