格策在2016年离开了拜仁慕尼黑，并重返多特蒙德。具体来说，在2016年7月21日，拜仁慕尼黑在其官方网站上正式宣布，德国国脚格策转会加盟多特蒙德。在拜仁官方宣布格策离队后不久，多特蒙德也在其俱乐部官方网站上宣布了格策的到来。格策在拜仁慕尼黑漂泊了3个赛季后，这位成长于多特蒙德青训营的德国国脚终于回家。接下来，格策将接受俱乐部为其组织的例行体检，随后他将与球队签署一份截止日期为2020年6月30日的合约。格策将于8月正式归队报到，并开始季前训练。
然而，格策在拜仁的表现并未达到预期，最终选择离开拜仁，回归多特蒙德。在多特蒙德，格策也未能重现其在拜仁时期的辉煌，进球效率大幅下滑，身价随之一路暴跌。尽管如此，格策凭借丰富的经验与球商，逐渐完成了自我转型，并在现东家找到了属于自己的位置。