鲍春来的伤病主要集中在 膝盖和脚踝。具体来说，他的脚踝在2006年汤尤杯前忽然疼痛，并且病症是游走性的，这次脚踝发病，下次可能轮到脚趾，几乎没有规律可循。2007年，鲍春来到协和医院做了化验，结果表明，他血液里的抗〇等指标超出常人好几倍，体内有严重的炎症，需要终生服药。然而，小鲍究竟得的是风湿还是痛风，一直没有明确诊断，只能按大概方向用药。但有一点可以确定，超负荷训练会增加身体负担，导致免疫力下降，病症复发。2008年，鲍春来犯病的次数逐渐增加，从每月一次，演变到两三周一次，再到一周一次，一度出现一周两次。2011年美国公开赛期间，鲍春来再度犯病，比赛前一晚卧床不起。同年9月，鲍春来退役。
此外，鲍春来的膝盖伤也很严重。2011年，他在大师赛前因膝伤宣布缺阵，并在北京进行休养。2011年9月，鲍春来在提交退役声明时，也提到是因为常年的膝伤困扰。德国专家建议他接受手术治疗，以便根治膝伤，但这将导致他错过当年的世锦赛和苏迪曼杯。
综上所述，鲍春来的主要伤病集中在膝盖和脚踝，这些伤病对他的羽毛球生涯产生了重大影响，最终导致他退役。