在福彩3D中，只选择两个号码进行投注是没有奖金的。根据规则，福彩3D需要选择三个号码，并且这三个号码的排列顺序也要与开奖号码一致才能中奖。具体的中奖规则如下：
单选：
投注号码与当期公布的中奖号码的3位数按位数全部相同，即中得单选奖，中奖金额为每注1040元。
组选3：
当期摇出的中奖号码3位数中有任意两位数字相同，且号码与中奖号码的数字相同，顺序不限，即中得"组选3"奖，中奖金额为每注346元。
组选6：
当期摇出的中奖号码中3位数各不相同，且号码的三个数字与当期中奖号码相同，顺序不限，即中得"组选6"奖，中奖金额为每注173元。
因此，选择两个号码进行投注在福彩3D中是不中奖的，只有选择三个号码并且号码的排列顺序与开奖号码一致才能获得奖金。