福彩3D的组六复式是指从000-999的数字中选择6个不同的数字，组成不重复的三位数，且这三位数的每一位数字都不相同。在组六复式中，投注者将这6个数字的所有排列方式只作为一注投注号码进行投注，因此，6个数字可以组成的不同排列方式共有 20种。
当进行六码组六复式投注时，需要投入的资金是 40元。这是因为从6个数字中选择3个数字作为胆码，剩下的3个数字作为拖码，可以组成三组4个号码的小复式进行投注，每组需要2元，共计24元；另外，再分别用所选的3个胆码中的任意一个胆码与其它号码进行组合，形成九组单独的组选6号码，每组需要2元，共计18元；最后，对不是胆码的号码进行组合，不需要额外资金。因此，六码组六复式总共需要投入40元。
综上所述，进行福彩3D六码组六复式投注，需要投入40元，共有20种不同的排列方式。