根据最新的税法规定，年终奖5万元需要缴纳的个人所得税为 4790元。具体计算方法如下：

1. 年终奖5万元，首先需要扣除免税额5000元，剩余45000元。

2. 45000元除以12个月，得到平均每月收入3750元。

3. 根据超额累进税率表，每月收入3750元对应的税率为10%，速算扣除数为210元。

4. 应纳税额 = 45000元 × 10% - 210元 = 4290元。

因此，年终奖5万元需要缴纳的个人所得税为4290元。

建议：在实际操作中，建议咨询专业的税务顾问或使用税务部门提供的计算工具，以确保计算的准确性和合法性。