台北城市联赛作为台湾地区的足球赛事，存在以下问题和争议：

赛制混乱：

城市联赛自2007年启动以来，赛制频繁变动，缺乏稳定性。例如，第一年规定县市队参赛，第二年则允许企业队参加，2009年设立升降级制度，2010年又取消，2014年甚至分出一个“上半赛季冠军”和“下半赛季冠军”，并让他们打总决赛。

参与度低：

由于足球在台湾地区并不普及，城市联赛的观众和参与度较低。联赛的规模和影响力有限，球队数量也较少，竞争力不强。

组织管理问题：

城市联赛在组织和管理上存在诸多问题，包括赛事组织混乱、管理不善等。这些问题导致联赛的观赏性和竞技水平受到影响。

性别歧视问题：

有报道称，城市联赛中存在性骚扰问题，严重影响了运动场馆的安全、尊重和友好环境。

竞技水平：

尽管有报道提到中华台北在亚洲杯预选赛中取得过一些令人瞩目的成绩，但这些成绩并不能代表台湾足球的整体水平。城市联赛中的球队在竞技水平上与亚洲其他国家和地区的球队存在较大差距。

综上所述，台北城市联赛在赛制、参与度、组织管理、性别歧视和竞技水平等方面存在诸多问题和争议。虽然联赛存在，但整体质量和影响力有限，难以吸引更多的关注和支持。