波波维奇和邓肯的合作始于1997年，当时波波维奇成为马刺队的主教练，并用状元签选中了邓肯。他们的合作持续了 28年，在这期间，波波维奇带领马刺队6次进入总决赛，5次夺得总冠军，并且3次当选最佳教练。

具体来说，从1997年到2016年，邓肯一直在马刺队效力，并在2016年退役。波波维奇在邓肯退役后并没有离开马刺队，而是继续担任主教练，直到2021年9月10日，波波维奇宣布将在赛季结束后退休。

因此，波波维奇和邓肯的合作关系持续了28年，从1997年到2021年。