男女下棋分开的主要原因包括：
体力差异：
棋类运动是一项需要高度集中注意力和持续体力的活动。男性在体力上通常比女性更强，这使得他们在长时间的比赛中具有优势。分开比赛可以确保女性选手在比赛中不会因为体力不支而受到影响。
棋力差距：
在多数棋类运动中，男性选手的平均水平普遍高于女性。例如，在中国象棋中，女子特级大师的水平通常相当于男子象棋大师的水平，而女子大师水平则相当于男子省市级冠军水平。这种差距使得男女同场竞技失去了意义。
思维差异：
男女棋手在思维方式上也存在差异。女性棋手通常更偏向于感性思维，下棋风格较为进攻；而男性棋手则更偏向于理性思维，更注重棋局的协调性和稳定性。这种思维方式的差异也会影响比赛结果。
生理差异：
女性在经期或其他特殊生理时期可能会面临身体上的不适，这可能会影响她们在棋类比赛中的表现。分开比赛可以避免这些生理因素对比赛结果的影响。
公平性：
将男女分开比赛可以确保女性选手在比赛中获得更公平的竞争环境。由于男性选手在整体水平上占优，分开比赛可以让女性选手在同等条件下展示自己的实力，从而获得更多的获奖机会。
综上所述，男女下棋分开主要是为了保障比赛的公平性、减少体力差异和思维差异对比赛结果的影响，以及照顾女性选手的生理需求。