托尼·帕克消失的原因主要有以下几点：

与艾米莉亚的契约关系：

帕克和艾米莉亚之间存在深厚的契约关系，艾米莉亚的潜意识影响使得帕克无法在圣域中露出身形。如果艾米莉亚无法正视过去，帕克也会被封印，无法像以前一样随意出现在她身边。

帮助艾米莉亚成长：

帕克的存在很大程度上是为了帮助艾米莉亚成长。他的消失可能与艾米莉亚的成长过程有关，因为他需要专注于支持艾米莉亚，而不是在其他地方活动。

寄居在魔石中：

帕克作为和爱蜜莉雅拥有契约的大精力，因为自己的本体不在身边，只能寄居在爱蜜莉雅的魔石中，每天晚上五点就只能休息消失。

年龄和竞技状态：

随着年龄的增长，帕克的竞技状态逐渐下滑，尽管他仍然才华横溢，但在球队中的地位已不如从前重要。他的离开为年轻球员提供了更多机会，展示了个人才华。

薪资空间和球队重建：

马刺队在经济层面和薪资管理方面面临压力，帕克的合同占据了相当大的薪资空间。随着球队重建的需求增加，帕克的存在变得非必要，迫使他作出分别的抉择。

个人因素：

帕克渴望在其他球队继续征程，追逐更大的荣耀。他转投黄蜂队，成为核心球员之一，有机会施展才华，奠定未来生涯基础。

与球队管理层的分歧：

帕克离开马刺队的原因之一是与球队管理层存在分歧，特别是关于薪资方面的不公平待遇。他对球队在季后赛中的表现感到失望，认为球队已经失去了以前的竞争力。

综上所述，帕克的消失是由于多种因素交织而成的结果，包括与艾米莉亚的契约关系、年龄和竞技状态的变化、薪资空间和球队重建的需求、个人职业发展的追求以及与球队管理层的分歧等。