佩佩选择不帮巴西而加入葡萄牙的原因主要有以下几点：

职业生涯发展：

佩佩的足球生涯在葡萄牙开始并逐渐崭露头角，他在葡萄牙取得了巨大的成功，因此对葡萄牙产生了深厚的感情。

竞争激烈：

巴西队人才济济，竞争非常激烈，佩佩在巴西国家队很难获得上场机会。

双重国籍：

巴西和葡萄牙都是葡萄牙语国家，佩佩和葡萄牙之间有很强的认同感。此外，如果一名球员没有代表成年国家队上场踢过正式比赛，是有可能更换国籍的。

个人情感：

佩佩在少年时期曾前往葡萄牙追梦，生活贫困，有一次在面包店得到老板的慷慨帮助（免费面包），这让他决定为葡萄牙国家队奉献自己。

葡萄牙主教练的引荐：

有观点认为，佩佩加入葡萄牙国家队可能与时任葡萄牙国家队主教练斯科拉里的引荐有关。

欧盟球员政策：

改国籍也有可能是为了迎合欧盟球员政策，这在一定程度上也有利于球员在欧盟国家的足球生涯发展。

综合以上几点，佩佩选择加入葡萄牙国家队而不是为巴西效力，是由于个人职业发展、竞争环境、双重国籍认同感、个人情感以及教练引荐等多方面因素的综合考量。