雷城在《盗墓笔记》系列小说和衍生作品中被描绘为一个充满神秘色彩的地方，其秘密主要包括以下几点：

听雷塔的秘密

雷城实际上是一座专门用于听雷的塔，深度达到上千米，地下还连接一道引雷管专门引雷下去。

听雷装置可以翻译完整的雷声，获取其中的秘密。田有金曾听到很重要的雷声，透露的信息非常大。

雷城塔底还有辅助听雷的液体，这种液体可能是哑巴皇帝棺材里面的珍贵棺液。

与成仙有关的传说

雷神在中国神话中是极其精确的“司杀”神，道家认为雷是人成仙的关键，因此古代方士都认为雷城是仙境，是成仙的捷径。

外星文明的遗迹

哑巴皇帝的足迹最终指向了雷城，传说中的雷公并不是神，而是一种高级且未知的外星文明，他们通过权杖从雷声里传递消息给哑巴皇帝，并让他修建了各种神迹。

治疗与预知未来的能力

吴邪通过听雷成功治疗了自己的肺病，这表明雷城具有某种治疗和预知未来的能力。

雷城还被认为可以抚平一切遗憾，吸引众人前去。

十一仓的秘密

十一仓有着上百年的历史，从来没人知道它具体位置在哪，这些仓管的身份更是无人知晓。不论是谁，有任何物品，皆可以存放十一仓，只要保存好完整的单据，不论过去多少年，都可以把东西取出来。

综合以上信息，雷城的秘密涵盖了听雷塔的构造、成仙传说、外星文明遗迹、治疗与预知未来的能力以及十一仓的神秘性。这些秘密构成了雷城丰富的背景故事，使其成为《盗墓笔记》系列中一个重要的谜团。