迈克尔·乔丹在其职业生涯中，主要效力于两支NBA球队，分别是 芝加哥公牛队和华盛顿奇才队。

芝加哥公牛队：

乔丹在1984年NBA选秀中以首轮第三顺位被芝加哥公牛队选中，从此开启了他的传奇职业生涯。在公牛队，他带领球队两次完成三连冠的伟业，并且个人五次荣膺常规赛最有价值球员（MVP），十次获得得分王称号。

华盛顿奇才队：

2000年1月19日，退役的乔丹入股华盛顿奇才队，并出任该队的运营总裁。华盛顿奇才队的前身是子弹队，曾经在1978年夺得过冠军，但在二十世纪八、九十年代长期是鱼腩，自1989年以来，他们只进过一次季后赛，1997年第一轮就被乔丹的公牛横扫。乔丹在奇才队期间，除了担任运营总裁外，还带领球队于2001年闯入季后赛。

因此，迈克尔·乔丹在NBA的主要效力球队是芝加哥公牛队和华盛顿奇才队。