曼联当初选择莫耶斯作为新任主教练，主要是基于以下几个原因：

弗格森的推荐：

弗格森对莫耶斯一直非常欣赏，早在1998年就曾建议他来曼联担任助教。弗格森在个人纪录片中也对莫耶斯褒奖有加，认为他是“被选中的一个”来接替自己。

球员时期的相似性：

莫耶斯的球员时期与弗格森相同，都有着强硬的足球理念和决不服从现实的态度。弗格森认为这种相似性使得莫耶斯能够更好地理解和继承自己的执教理念。

业界的口碑：

莫耶斯在埃弗顿的多年耕耘积攒下了良好的业界口碑，尽管他没有拿得出手的冠军锦标，但他在球队建设方面擅长拔擢青训精英，并且能够围绕高水平外援制定战术，这与曼联的风格不谋而合。

稳定的未来：

曼联希望拥有一个能长期执教的主教练，莫耶斯在埃弗顿执教了11年，说明他愿意为一支俱乐部持续奉献。他的稳定性和长期执教的意愿符合曼联的需求。

战术和球队建设理念：

莫耶斯注重青训，这也符合曼联的传统。弗格森在曼联曾培养了贝克汉姆、吉格斯等一大批球星，而莫耶斯在埃弗顿也培养出了以鲁尼为代表的一批球星。

接手时的实际情况：

莫耶斯接手曼联时，虽然面临诸多挑战，如更衣室混乱、球队伤病连连等问题，但他的到来也给球队带来了一种“重建”的希望，并且他能够稳住阵脚，维护团队的器量。

综上所述，曼联选择莫耶斯作为新任主教练，主要是基于弗格森的推荐、两人球员时期的相似性、莫耶斯在业界的口碑、他稳定的执教意愿以及战术和球队建设理念上的契合。然而，尽管莫耶斯有着诸多优势，他在曼联的执教经历也充满了挑战和争议。