斯科拉里被罚的原因主要涉及以下几个方面：
不满裁判判罚并暴怒
在2007年欧锦赛小组赛葡萄牙对阵塞尔维亚的比赛中，斯科拉里因不满裁判判罚而暴怒，赛后冲入场中并挥拳击打对方球员德拉古蒂诺维奇。这一行为导致他被欧足联禁止现场指挥三场欧锦赛小组赛，并罚款12000欧元。
指责裁判，干扰比赛
2017年，斯科拉里在与延边的比赛中指责裁判，干扰比赛，因此被足协停赛3场，罚款1.5万元。在比赛最后时刻，尽管裁判认定恒大进球有效，但斯科拉里因激动冲进球场与裁判争论，最终被罚。
发表不负责任言论
2017年3月，斯科拉里在赛后新闻发布会上发表不负责任言论，被停赛1场，罚款8000元。他公开指责中国足协对于郑智的处罚不公平，并暗示这是因为足协要帮助上港阻击恒大的原因。
总结：
斯科拉里被罚的原因主要包括不满裁判判罚并暴怒、指责裁判干扰比赛以及发表不负责任言论。这些行为严重违反了比赛规则和体育道德，因此受到了相应的处罚。