孙杨在职业生涯中遭受了多种伤病，具体包括：
甲沟炎：
2014年1月，由于长年浸泡在水中训练，孙杨双脚的大脚趾出现了严重的甲沟炎，最终不得不进行了拔除手术。
左手拇指挫伤：
2014年9月22日，在仁川亚运会200米自由泳比赛中，孙杨在触壁时不小心挫伤了左手拇指。
左手拇指骨头错位：
2015年1月，在澳洲冬训期间，孙杨的左手拇指出现错位，后来通过塑料夹板固定。
脸部晒伤：
2015年1月，在澳洲，由于长时间在露天泳池训练，孙杨的脸部皮肤被严重晒伤。
右脚第五跖骨骨折：
2016年1月，在澳洲集训期间，孙杨不慎右脚脚趾骨折，保守估计需要6周才能痊愈。
右脚第四跖骨疲劳性骨折：
2016年5月底，孙杨在复查时发现右脚第四跖骨也出现了疲劳性骨折。
膝盖和肩膀伤病：
孙杨身上还有因长期长距离训练带来的心脏不适及肩部损伤，膝盖和肩膀打过近30次封闭。
这些伤病对孙杨的职业生涯产生了一定的影响，但他凭借顽强的毅力和专业的治疗，仍然在赛场上取得了优异的成绩。