佩佩离开皇马的原因是多方面的，主要包括以下几点：

年龄和身体原因：

佩佩年纪渐长，竞技状态和身体状况已经不如当年。齐达内和皇马高层认为他已不可能像巅峰时期那样在场上发挥关键作用。

合同问题：

佩佩希望获得一份大合同，但皇马无法满足他的要求，因此他选择离开。

更衣室矛盾：

穆里尼奥对佩佩的态度恶劣，曾在更衣室会议上嘲讽他，导致两人关系紧张。佩佩的场上频繁犯规和暴力行为也加剧了与穆里尼奥的矛盾，最终导致穆里尼奥离开皇马。

个人不满：

佩佩对皇马高层的处理方式感到不满，认为俱乐部没有给予他足够的支持和尊重。

综合以上几点，佩佩最终决定离开皇马，寻求新的挑战和机会。