菲律宾男篮退出2018年亚运会的主要原因包括：
国际篮联的处罚：
在2018年男篮世界杯亚太区预选赛中，菲律宾男篮与澳大利亚男篮发生大规模群殴事件，导致菲律宾队10名球员和2名教练被禁赛。尽管国际篮联的禁赛处罚仅适用于世界杯预选赛，但这一事件对菲律宾篮协产生了深远影响，迫使其做出退出亚运会的决定。
球队重建：
菲律宾篮协认为球队需要重建，重新塑造良好的素质和提高篮球技术。退出亚运会可以为球队提供更多的重建时间和空间，以便在2019年男篮世界杯亚洲区预选赛中取得更好的成绩。
上诉国际篮联：
菲律宾篮协准备对国际篮联近期对菲律宾男篮作出的处罚提起上诉，以争取减轻或取消禁赛处罚。
备战2019年男篮世界杯：
菲律宾男篮需要更多的时间来准备2019年男篮世界杯亚洲区预选赛，以确保在下一阶段的比赛中取得更好的成绩。
民众和政府压力：
在宣布退赛后，菲律宾民众强烈反对，政府官员也被迫介入。这种压力迫使菲律宾篮协重新考虑其决定，并最终决定继续参加亚运会。
避免最差战绩：
有报道称，菲律宾篮协担心球队在亚运会上刷新2014年仁川亚运会第7名的历史最差战绩，因此选择退出亚运会。
综合以上原因，菲律宾男篮的退赛决定是基于多方面的考虑，包括国际篮联的处罚、球队重建、上诉、备战需求以及民众和政府的压力。